Gizli Bahçe, ailesini kaybetmiş Marry adlı küçük bir kızın tek akrabası olan eniştesinin yanına taşınmasını ve burada esrarengiz bir şekilde bir bahçe keşfetmesini ve bu bahçenin yalnız kendi yaşamını değil bir çok yaşamı etkilemesini konu alıyor.